是依靠自己的结构特异性来特定的tev。
蛋白酶其实也是蛋白质，由氨基酸构成。氨基酸在空间的不同排布构成了蛋白酶多种多样的三级结构或四级结构。以烟草花叶病毒蛋白酶（TEV）为例，TEV是一种来自于烟草花叶病毒的蛋白酶，它的氨基酸在空间中有序排列，并且折叠成一定的空间结构。具体来说，TEV由两个β桶状结构（ β-barrels）和一个柔性的C端尾部组成。两个β-barrels形成了一个通道，可以将反应底物卡在通道中进行反应。通道的侧壁上的一些氨基酸侧链对于底物具有选择性，假如底物不能完全与通道中的各个残基相互作用，那么就不会达到能量最低的稳定态，结构也不会稳定，底物就会跑出这个通道，其他的底物再进来，假如恰好合适，那么酶就会与这个底物结合在一起，通过酶的催化活性中心来对底物进行催化反应。
打个比方，特定的酶具有特定的选择性通道，就好像一个侦探手上有特定的嫌疑犯的特征，酶根据特定的选择通道来识别底物（蛋白质），就相当于一个侦探对照着自己收录的嫌犯信息来找嫌疑犯。
另外，分子在溶液中的运动是无序且快速的，不用担心蛋白酶找了好久都没有找到合适的蛋白质来将其降解，只要达到一定的浓度，这个反应就一定可以发生，而且酶的反应速度一般要比化学催化剂快很多。
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